112年-25-實作學生:全校不分系學士學位學程【方文廷】

參賽序號:25

海報主題

不同cfDNA萃取方法對液態切片診斷的影響

系級

全校不分系學士學位學程

指導老師及參賽學生

指導老師:黃偉倫
參賽學生:方文廷

構想說明

本次研究除了使用標準的cfDNA管柱法,我們也設計萃取條件較嚴苛(迫使DNA更容易沉降)的管柱法及磁珠法,測試是否使用不同的萃取方式有機會得到不同的cfDNA產物。為了分析微量的cfDNA,我們library preparation進行放大,並以Tapestation微流體電泳分析儀分析cfDNA產物。我們發現,使用標準的cfDNA管柱萃取法能有效地獲得最廣為人知,大小約150 bp的mono-nucleosome 的雙股cfDNA。若使用條件嚴苛的管柱法及磁珠法,還會得到一群短片段(約50 bp)、單股的新穎cfDNA。此外,我們分析肺癌病人血漿及惡性胸水檢體,在其中也發現這群新穎的cfDNA。未來將進一步分析這群新穎的cfDNA在液態切片診斷應用上的潛力。

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