115年4-4-實作學生:化工系 【吳博楷】

參賽序號：4-4

海報主題

GIGA-RFP: 基於生成式與整合幾何架構之從頭設計紅色螢光蛋白 GIGA-RFP: Generative and Incorporated Geometric Architectures for de novo Red Fluorescent Protein design

系級

化工系

指導老師及參賽學生

指導老師：吳意珣
參賽學生：吳博楷

構想說明

隨著近幾年人工智慧與深度學習的快速發展，2024年諾貝爾化學獎與 ESM3設計出突破自然界演化的綠色螢光蛋白都象徵著蛋白質設計進入了全新的時代，現在能夠從頭設計出全新的蛋白質。本計劃利用 RFdiffusion與 SolubleMPNN進行骨架與序列的從頭設計，之後透過結構信心分數、溶解度與螢光等參數篩選出少部分具備高潛力的序列進行濕實驗驗證。
最後的候選序列將透過 Escherichia coli進行實驗驗證。本計劃旨在成功生成出全新的紅色螢光蛋白序列，並提供開發未知蛋白質的一條全新的思維與路徑。

 

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